1、         严重并发症：

（1）           穿孔：国外报道大约占内镜的0.3％。最常见部位为食管下段及咽喉部梨状窝，占穿孔的50％。往往由于病人部配合或检查者操作过于粗暴，使用侧视镜通过贲门时易发生穿孔。穿孔一旦发生，患者立即出现上腹部剧痛无法忍受，或出现纵隔颈部皮下气肿，应及时拍片定位，如发现纵隔气肿或气腹等现象，应及时手术治疗。

（2）           心脑血管意外：国外报道发现心脑血管意外，可能与进镜后引起迷走神经兴奋有关。由于检查致心脑血管意外死亡者报道少见，报道内镜后脑梗死或脑出血者实属罕见。

（3）           感染：国外报道上消化道内镜检查后可出现吸入性肺炎，约占0.07％，可能为患者严重体弱或使用过度镇静剂所致；50％食管静脉曲张患者在行硬化治疗后可出现暂时性菌血症；此外，由于内镜污染而传染疾病，如丙型、乙型病毒性肝炎等，亦鲜有报道。

2、         一般并发症：

（1）           下颌关节脱臼，可进行手法复位。

（2）           喉头痉挛，应立即退出内镜以解除呼吸困难。

（3）           食管贲门撕裂，往往由于检查中患者过度呕吐所致。

（4）                   咽部感染或脓肿，是由于操作内镜引起损伤。